影片尾声,如花把胭脂扣还给十二少,头也不回地飘然远去。对这一结尾,关锦鹏说,当时的如花应该有种“哀莫大过于心死”的感觉,这也是他许多作品里出现过的情绪。《长安三万里》与其他影片最大的不同,就在于它大体上是遵循历史走向,有着坚实的现实基础。中国电影评论学会会长饶曙光评价,“《长安三万里》的横空出世,需要我们对动画电影有全新的认知。过去我们习惯上认为,动画电影偏娱乐性,不可能表现宏大的、具有史诗气质的题材。那么在该片以后,可以说动画电影也可以成为具有史诗气质、史诗品格的电影。从某种意义上说,《长安三万里》开创了中国动画电影的新文化、新美学。”